W211针对2003年车型年进行了更新，以解决早期车型出现的质量和技术问题。有了新的标准和可选设备，这使W211保持领先自己的竞争对手。而预安全（不带制动支架）被定为标准配备。该车于2006年纽约国际车展上发布。共有29款车型可供选择，共有16款轿车和13种旅行车。新的标准设备包括预安全主动保护装置、NECK-PRO头枕、闪光制动灯、轮胎压力监测器。可选的智能照明系统包括双氙气前照灯和5种不同的照明功能。
W 211车型系列梅赛德斯-奔驰E级中PRE-SAFE?预期乘员保护系统的功能。如果电脑存在发生事故的风险，PRE-SAFE?可以拉紧前排安全带，将具有记忆功能的电动可调前排乘客座椅移动到更有利的位置，并关闭侧窗和滑动天窗，以防万一让驾乘人员第一时间脱险
与小改款同时，E级车系中最高级别的E500（在一些国家标榜为E550）发动机尺寸从5升增加到了2006年的5.5升。此外，还有一个AMG型号E63 AMG。在2006年北美国际车展上，梅赛德斯-奔驰将其BlueTec柴油系统作为E320 CDI BlueTec引入E级。BlueTec是一个用于清洁柴油排放物的两相系统。第一阶段使E320 CDI在美国50个州中的45个州（加上哥伦比亚特区）合法化。第二阶段使用尿素进一步削减，以满足加利福尼亚、缅因、马萨诸塞、纽约和佛蒙特州更严格的标准。
2007年，梅赛德斯-奔驰开始在欧洲引进新的BLUETEC柴油技术。2007年9月在法兰克福举行的国际汽车展览会上，斯图加特品牌展示了新款E 300 BLUETEC，作为211系列的最新车型。2007年12月，这台来自商务舱的最清洁、最节俭的EU5柴油机进入欧洲市场。凭借这两款车型，E级率先在所有车型系列展开奔驰攻势。因为在未来的几年里，BLUETEC将在“梅赛德斯-奔驰通往未来的道路”上推出C级到R级车型的变种。
与美国版本（155千瓦/211马力而不是165千瓦/224马力）相比，新款BLUETEC车型的峰值输出略低，这是为了改善排放而采取的措施所致。进一步的优化措施包括特殊的压电喷射器和涡轮增压器和废气再循环的选择性微调。1600转/分时540牛顿米的峰值扭矩不变，保证了低油耗和非常干净的废气的轻松优越性能。E 300 BLUETEC的NEDC油耗约为每100公里7.3升柴油。
前瞻性的新发展继续使E级成为汽车安全的先锋。在未来，轿车和旅行车将采用预期的PRE-SAFE?系统作为标准配置，如果发生事故，该系统几乎会本能地启动驾驶员和前排乘客的保护措施。该系统获得多项大奖，使安全带和安全气囊在碰撞时发挥最佳功能。这一级别的独特之处还包括标准的NECK-PRO头枕：传感器控制，在发生追尾碰撞时为驾驶员和前排乘客提供头部支撑。梅赛德斯-奔驰还为新一代E级配备了刹车灯，在紧急刹车时闪烁，有助于避免追尾碰撞。
新一代E-Class是世界上第一款提供自适应前照灯的汽车，可根据当前的驾驶状况和天气条件进行最佳调整。这大大提高了安全性。智能照明系统可作为轿车和旅行车的可选配件，包括五种不同的照明功能。
直接控制使更灵活的处理成为可能。这套标准配置包括增加10%的直接转向、新开发的弹簧连杆轴承和六速手动变速器的新换档控制，以提高换档的便利性和更精确的换档。此外，优雅和前卫的模型配备了回弹缓冲弹簧，有效地限制了车身侧倾期间。来自梅赛德斯奔驰新S级的是自适应制动系统，它通过液压双回路制动器的电子控制实现了新的安全和舒适功能。自动轮胎压力损失报警系统也是E级扩展标准设备的一部分。